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Do grego Hyppokampos, cavalo marinho; Hippos, cavalo e Kámpos, monstro marinho.
Na mitologia grega, hippokampos era o nome dos animais marinhos atrelados ao carro-concha do deus dos mares Poseidon (Netuno, para os romanos).
A parte anterior do corpo era em forma de cavalo e a parte posterior exibia uma longa cauda de peixe enrolada.
Estes animais eram frequentemente esculpidos nas fontes romanas, sendo considerados de bom agouro.
Giulio Cesare Arancio (1560) foi o primeiro a usar o termo para designar o hipocampo do cérebro, talvez pelasemelhança deste com a pata do animal mitológicio.
Plinio usou o mesmo termo para nomear peixes teleósteos (os cavalos marinhos).
Uma pequena parte do hipocampo ficou conhecida como "corno de Ammon" e duas são as possíveis explicações para seu nome.
Para uns, a secção transversal da parte posterior do hipocampo assemelha-se a um chifre de carneiro (Ammon era um deus Egipcio rrepresentado por uma cabeça de carneiro).
Para outros, é epônimo derivado do nome do anatomista que descreveu esta formação em detalhes (Friedrich August Von Ammon - 1799-1861).